עיקרון העבודה של מגדל הקומפוסטציה כולל בעיקר את ההיבטים הבאים:
עיבוד ותסיסה חומרים: לאחר טיפול מקדים, החומר מורם מתחתית מגדל הקומפוסט לחלק העליון של המגדל דרך מכשיר ההרמה, ואז מתפשט באופן שווה לשכבה העליונה של מגדל התסיסה דרך מכונת ההתפשטות. החומרים בכל שכבה נופלים לשכבה הבאה לתסיסה דרך הדש בהתאם למחזור הפנייה של הסט ושינויי טמפרטורת התסיסה. במהלך תהליך התסיסה ניתן לשלוט על הטמפרטורה והלחות על ידי מכשירי עזר כמו חימום ואוורור לקידום פעילות מיקרוביאלית ולהאיץ את פירוק החומר האורגני.
התפרקות ביולוגית: מגדל הקומפוסטציה משתמש בשפירה ביולוגית של תולעי אדמה כדי להמיר פסולת אורגנית לדשן אורגני איכותי העשיר בחומר אורגני וחומצות אמינו. תולעי אדמה מתפרקות פסולת אורגנית באמצעות מערכת האנזים הביולוגית שלהן, וזבל תולעי האדמה המיוצר אינו רעיל וחסר ריח, מתאים לדשן אדמה.
יתרונות סביבתיים: מגדל הקומפוסט יכול להפחית את הזיהום הסביבתי הנגרם כתוצאה מהטמנה ושריפה, להמיר פסולת אורגנית למשאבים שימושיים באמצעות התפרקות ביולוגית ולהפחית את ההשפעות השליליות על הסביבה. בנוסף, ניתן לשלוט ולנהל את החום והגז שנוצר במהלך תהליך הקומפוסטציה באמצעות מכשירי אוורור וחימום מתאימים.
